Tres Zapotes
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Tres Zapotes

A ocupação do sítio começou por volta de 900 aC, mas até o período epiolmeca (400 aC-300 dC), tornou-se o centro mais importante da região. Naquela época, os olmecas já usavam o "zero" em suas operações matemáticas que foram baseados no uso de barras e pontos.

Dentro do site, o grupo mais importante é conhecido como "grupo Arroio" e está localizado na parte sudoeste do site. O montículo principal desse grupo é conhecido pela população local como "Colina Camila " (onde a estela D foi encontrada), que tem 12 metros de altura acima da planície. No lado norte da praça é a "Colina longa" (onde a estela A foi encontrada), que é de 7 metros de altura e 130 metros de comprimento, e no extremo oeste há dois montes de 5 metros de altura, delimitando uma praça de cerca de 300 metros de comprimento por 200 metros de largura.

Estudos estratigráficos indicam que Tres Zapotes foi afetada por uma ou mais das erupções do vulcão San Martin; Provavelmente é por isso que os seus habitantes se mudaram para terras mais altas.